LICENSE
MANIFEST.in
README.txt
readme.txt
setup.py
nexus/__init__.py
nexus/reader.py
nexus/writer.py
nexus/bin/__init__.py
nexus/bin/nexus_anonymise.py
nexus/bin/nexus_binary2multistate.py
nexus/bin/nexus_combine_nexus.py
nexus/bin/nexus_deinterleave.py
nexus/bin/nexus_describecharacter.py
nexus/bin/nexus_describetaxa.py
nexus/bin/nexus_multistate2binary.py
nexus/bin/nexus_nexusmanip.py
nexus/bin/nexus_randomise.py
nexus/bin/nexus_tally.py
nexus/bin/nexus_to_fasta.py
nexus/bin/nexus_treemanip.py
nexus/examples/example-beast.trees
nexus/examples/example-characters.nex
nexus/examples/example-comments.nex
nexus/examples/example-translated.trees
nexus/examples/example.nex
nexus/examples/example.trees
nexus/examples/example2.nex
nexus/examples/example3.nex
nexus/test/__init__.py
nexus/test/test_reader.py
nexus/test/test_reader_manipulation.py
nexus/test/test_regressions.py
nexus/test/test_writer.py
nexus/test/test_tools/__init__.py
nexus/test/test_tools/test_CheckForValidNexusReader.py
nexus/test/test_tools/test_CombineNexuses.py
nexus/test/test_tools/test_CountSiteValues.py
nexus/test/test_tools/test_FindConstantSites.py
nexus/test/test_tools/test_FindUniqueSites.py
nexus/test/test_tools/test_Multistatise.py
nexus/test/test_tools/test_NewNexusWithoutSites.py
nexus/test/test_tools/test_ResampleTrees.py
nexus/test/test_tools/test_ShuffleNexus.py
nexus/test/test_tools/test_anonymise.py
nexus/test/test_tools/test_binarise.py
nexus/test/test_tools/test_treemanip.py
nexus/tools/__init__.py
nexus/tools/binarise.py
nexus/tools/check_for_valid_NexusReader.py
nexus/tools/combine_nexuses.py
nexus/tools/multistatise.py
nexus/tools/shufflenexus.py
nexus/tools/sites.py
python_nexus.egg-info/PKG-INFO
python_nexus.egg-info/SOURCES.txt
python_nexus.egg-info/dependency_links.txt
python_nexus.egg-info/top_level.txt